Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX8Q68G74 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX8Q68G74 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms