Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLFN13Q68D06 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLFN13Q68D06 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms