Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREB3L3Q68CJ9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREB3L3Q68CJ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREB3L3Q68CJ9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms