Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms