Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZKSCAN2Q63HK3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN2Q63HK3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZKSCAN2Q63HK3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms