Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT79Q5XKE5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms