Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USPL1Q5W0Q7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USPL1Q5W0Q7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms