Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM236Q5W0B7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM236Q5W0B7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 404.4 ms