Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FOCADQ5VW36 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOCADQ5VW36 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms