Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BROXQ5VW32 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BROXQ5VW32 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms