Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACHD1Q5VU97 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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