Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GFI1BQ5VTD9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GFI1BQ5VTD9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms