Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP350Q5VT06 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CEP350Q5VT06 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms