Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C12orf60Q5U649 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C12orf60Q5U649 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms