Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BEND3Q5T5X7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BEND3Q5T5X7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms