Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC39AQ5SRH9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39AQ5SRH9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC39AQ5SRH9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC39AQ5SRH9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC39AQ5SRH9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC39AQ5SRH9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC39AQ5SRH9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC39AQ5SRH9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC39AQ5SRH9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC39AQ5SRH9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC39AQ5SRH9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC39AQ5SRH9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC39AQ5SRH9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms