Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP188Q5SRE5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP188Q5SRE5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
NUP188Q5SRE5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms