Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN4Q56A73 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN4Q56A73 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms