Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms