Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC0

ATP13A5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A5Q4VNC0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A5Q4VNC0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A5Q4VNC0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms