Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVEP1Q4LDE5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms