Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01620Q4KN68 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01620Q4KN68 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01620Q4KN68 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01620Q4KN68 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01620Q4KN68 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01620Q4KN68 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01620Q4KN68 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01620Q4KN68 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms