Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01559Q495D7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01559Q495D7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms