Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP6Q3SY56 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms