Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP13-3Q3SY46 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP13-3Q3SY46 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms