Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRIT3Q3SXY7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms