Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TWISTNBQ3B726 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TWISTNBQ3B726 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms