Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms