Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNOP1Q1ED39 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KNOP1Q1ED39 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KNOP1Q1ED39 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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