Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LONRF1Q17RB8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LONRF1Q17RB8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LONRF1Q17RB8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
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