Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK4Q16654 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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