Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFIL3Q16649 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIL3Q16649 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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