Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM1Q16610 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM1Q16610 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
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