Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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KCNMB1Q16558 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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KCNMB1Q16558 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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KCNMB1Q16558 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMB1Q16558 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
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