Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRA6Q16445 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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