Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC6Q16204 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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