Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RAB11BQ15907 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RAB11BQ15907 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RAB11BQ15907 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RAB11BQ15907 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RAB11BQ15907 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RAB11BQ15907 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11BQ15907 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RAB11BQ15907 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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RAB11BQ15907 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB11BQ15907 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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