Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGN3Q15651 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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