Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC23AQ15436 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC23AQ15436 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23AQ15436 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
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