Protein–RNA interactions for Protein: Q15349

RPS6KA2, Ribosomal protein S6 kinase alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA2Q15349 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPS6KA2Q15349 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS6KA2Q15349 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms