Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NECTIN1Q15223 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NECTIN1Q15223 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms