Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCOLCEQ15113 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
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