Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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