Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFIXQ14938 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFIXQ14938 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
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