Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDC1Q14676 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MDC1Q14676 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MDC1Q14676 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MDC1Q14676 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1
MDC1Q14676 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MDC1Q14676 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MDC1Q14676 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDC1Q14676 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MDC1Q14676 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MDC1Q14676 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MDC1Q14676 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MDC1Q14676 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MDC1Q14676 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MDC1Q14676 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDC1Q14676 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDC1Q14676 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MDC1Q14676 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MDC1Q14676 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDC1Q14676 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDC1Q14676 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MDC1Q14676 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDC1Q14676 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDC1Q14676 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDC1Q14676 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDC1Q14676 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MDC1Q14676 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDC1Q14676 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDC1Q14676 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDC1Q14676 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MDC1Q14676 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDC1Q14676 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MDC1Q14676 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDC1Q14676 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MDC1Q14676 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDC1Q14676 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MDC1Q14676 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDC1Q14676 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MDC1Q14676 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDC1Q14676 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDC1Q14676 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDC1Q14676 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MDC1Q14676 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDC1Q14676 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MDC1Q14676 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MDC1Q14676 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDC1Q14676 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDC1Q14676 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MDC1Q14676 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDC1Q14676 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MDC1Q14676 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDC1Q14676 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDC1Q14676 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MDC1Q14676 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDC1Q14676 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDC1Q14676 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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