Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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GBX1Q14549 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBX1Q14549 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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GBX1Q14549 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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GBX1Q14549 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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GBX1Q14549 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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GBX1Q14549 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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