Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1A4Q13733 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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