Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CUL4BQ13620 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4BQ13620 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4BQ13620 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms