Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL1Q13616 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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