Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PWP1Q13610 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PWP1Q13610 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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